انفورماتیک در زیست شناسی، بهداشت و غذا

انفورماتیک در زیست شناسی، بهداشت و غذا

مطالعه بیوانفورماتیکی نقشLncRNA-SLC7A11-AS1 در پیشرفت هپاتوسلولار کارسینوما از طریق سرکوب فروپتوز

نوع مقاله : مقاله پژوهشی

نویسندگان
1 سازمان آموزش و پرورش خراسان جنوبی، بیرجند، ایران
2 گروه زیست شناسی، دانشکده علوم، دانشگاه بیرجند، بیرجند، ایران
چکیده
هپاتوسلولار کارسینوما شایع­ترین فرم سرطان کبد است که حدود 90 درصد موارد ابتلا را شامل می­شود. آمار رو به رشد این سرطان، اهمیت درک بهتر مکانیسم­های بیماری­زایی و شناسایی اهداف درمانی جدید را به روشنی نشان می­دهد. امروزه مرگ سلولی برنامه­ریزی شده وابسته به آهن (فروپتوز) در این خصوص بسیار مورد توجه قرار گرفته است. یکی از تنظیم کننده‌های مهم فروپتوز، RNAsهای غیر کد کننده طویل (LncRNA) هستند که با تنظیم سطح بیان ژن­های پایین دست خود، در بسیاری از روندهای سلولی از جمله مسیرهای مرتبط با سرطان­زایی نقش دارند. در مطالعه حاضر با بررسی بیوانفورماتیکی داده‌های ثبت شده در پایگاه داده GEO، مربوط به آنالیز RNA-seq، به بررسی ژن‌های تغییر بیان یافته در نتیجه  سرکوب Lnc-RNA  SLC7A11  در رده سلولی سرطانی انسانی هپاتوسلولار کارسینوما (HepG2) پرداخته شد. نتایج حاصل نشان داد اصلی‌‌ترین‌ ژن‌های ‌ تغییر بیان یافته در این مطالعه در مکانیسم فروپتوز درگیر هستند و از این طریق در پیشرفت سرطان دخالت می­کنند. در نتیجه این LncRNA می­تواند به عنوان یک هدف درمانی مهم در مطالعات آزمایشگاهی آینده مورد توجه قرار گیرد.
کلیدواژه‌ها

موضوعات


عنوان مقاله English

Bioinformatics Study of the Role of LncRNA-SLC7A11-AS1 in the Progression of hepatocellular Carcinoma through the Suppression of Ferroptosis

نویسندگان English

malihe safarioun 1
homa mollaei 2
1 Education Organization of South Khorasan, Birjand, Iran
2 Department of Biology, Faculty of Sciences, University of Birjand, Birjand, Iran
چکیده English

Hepatocellular carcinoma is the most common form of liver cancer, accounting for about 90% of cases. The rising statistics of this cancer clearly highlight the importance of better understanding the mechanisms of pathogenesis and identifying new therapeutic targets. Nowadays, iron-dependent programmed cell death (ferroptosis) has extended significant attention. Long non-coding RNAs (lncRNAs), key regulators of ferroptosis, play critical roles in various cellular processes, including pathways involved in carcinogenesis, by modulating the expression of downstream genes. In the present study, by analysis the bioinformatics data recorded in the GEO database related to RNA-seq analysis, we investigated the differentially expressed genes resulting from the suppression of LncRNA SLC7A11 in the human hepatocellular carcinoma (HepG2) cell line. The results indicated that the main differentially expressed genes in this study were involved in the ferroptosis mechanisms, contributing to cancer progression. Consequently, this LncRNA could be considered an important therapeutic target for future laboratory investigation.

کلیدواژه‌ها English

Bioinformatics
LncRNA
hepatocellular carcinoma
ferroptosis

  • تاریخ دریافت 14 مهر 1403
  • تاریخ بازنگری 05 آبان 1403
  • تاریخ پذیرش 20 آبان 1403