انفورماتیک در زیست شناسی، بهداشت و غذا

انفورماتیک در زیست شناسی، بهداشت و غذا

مقایسه و ارزیابی مدل‌های آماری مختلف برای برآورد وراثت‌پذیری صفات اقتصادی مهم در مرغ بومی ایران با بهره‌گیری از روش‌های بیزی

نوع مقاله : مقاله پژوهشی

نویسندگان
1 گروه علوم دامی، دانشگاه فردوسی مشهد، مشهد،ایران.
2 آموزشگاه آراز زیست فناور،مشهد،ایران.
چکیده
هدف این پژوهش، برآورد وراثت‌پذیری، همبستگی‌های ژنتیکی و فنوتیپی و بررسی اثرات مادری در صفات اقتصادی مرغ‌های بومی ایران در مرکز اصلاح‌نژاد خراسان رضوی (KRBC) بود. اجزای واریانس برای صفات وزن بدن در سنین ۸ (BW8) و ۱۲ (BW12) هفتگی، سن بلوغ جنسی (ASM) ، وزن در بلوغ، تعداد تخم‌مرغ (EN) و میانگین وزن تخم‌مرغ در هفته‌های ۲۸، ۳۰ و ۳۲ (EW) برآورد شد. برای هر صفت، مدل‌های حیوانی شامل و بدون اثرات مادری با روش بیزی و الگوریتم نمونه‌گیری گیبس در نرم‌افزار GIBBS3F90 تحلیل شدند. انتخاب مناسب‌ترین مدل بر اساس شاخص اطلاعات انحرافی (DIC) انجام گرفت. داده‌ها شامل 18000 رکورد از سه نسل مرغ بومی جمع‌آوری‌شده طی سال‌های ۲۰۰۹ تا ۲۰۱۲ بودند. نتایج نشان داد برای صفت سن بلوغ جنسی، مدل شامل اثر ژنتیکی مستقیم بهترین برازش را داشت. در حالی‌که برای وزن در بلوغ و وزن بدن در ۸ و ۱۲ هفتگی، مدل‌های حاوی اثرات ژنتیکی مستقیم، مادری و محیطی دائم مناسب‌تر بودند. برای تعداد تخم‌مرغ، مدل دارای اثرات ژنتیکی مستقیم و مادری، و برای وزن تخم‌مرغ، مدل شامل اثرات ژنتیکی مستقیم و محیطی دائم مادری بهترین نتایج را ارائه داد. وراثت‌پذیری مستقیم بین ۱۳٪ (تعداد تخم‌مرغ) تا ۴۶٪ (وزن تخم‌مرغ) متغیر بود. حذف اثرات مادری موجب بیش‌برآورد وراثت‌پذیری مستقیم در اغلب صفات شد. بنابراین، برای صفات وزن بدن و ویژگی‌های مرتبط با تخم‌مرغ، لحاظ اثرات ژنتیکی مستقیم و مادری در مدل ضروری است. همچنین همبستگی ژنتیکی مثبت بین صفات رشد ( BW8، BW12و وزن بلوغ (با سن بلوغ جنسی مشاهده شد؛ به‌طوری‌که انتخاب برای رشد سریع‌تر ممکن است منجر به افزایش سن بلوغ شود. از آنجا که مرغ‌های بومی دارای کارکرد دوگانه (گوشتی–تخم‌گذار) هستند، استفاده از شاخص‌های انتخابی که هم‌زمان رشد بالاتر و کاهش سن بلوغ را هدف قرار دهند، برای بهبود عملکرد اقتصادی ضروری است.
کلیدواژه‌ها

موضوعات


عنوان مقاله English

Comparison and evaluation of different statistical models for estimating the heritability of important economic traits in Iranian native chickens using Bayesian methods

نویسندگان English

Fereshte Ghadamgahi 1
Amirhossein Alizadeh Kaseb 2
Sattar Rezaei Baranvand 2
1 Department of Animal Science, Ferdowsi University of Mashhad, Mashhad, Iran
2 Araz Biotech Academy, Mashhad, Iran.
چکیده English

The objective of this study was to estimate heritability, genetic and phenotypic correlations, and to assess maternal effects for major economic traits in native chickens of Iran maintained at the Khorasan Native Fowl Breeding Center (KRBC). Variance components were estimated for body weight at 8 weeks (BW8) and 12 weeks (BW12), age at sexual maturity (ASM), body weight at sexual maturity (WSM), egg number (EN), and average egg weight at 28, 30 and 32 weeks (EW). Each trait was analyzed using animal models with and without maternal effects under a Bayesian framework employing Gibbs sampling in GIBBS3F90. The most appropriate model for each trait was identified based on the Deviance Information Criterion (DIC). The dataset comprised 18000 records collected across three generations (2009–2012). Results indicated that, for ASM, the model including only direct genetic effects provided the best fit, whereas for WSM and BW8–BW12, models including direct, maternal genetic, and permanent maternal environmental effects were superior. For EN, the model including both direct and maternal genetic effects was optimal, while for EW the model containing direct genetic and permanent maternal environmental effects performed best. Direct heritability estimates ranged from 0.13 (for EN) to 0.46 (for EW). Exclusion of maternal effects generally led to overestimation of direct heritability. Therefore, inclusion of both direct and maternal genetic effects is essential for accurate evaluation of body weight and egg related traits. Positive genetic correlations between growth traits (BW8, BW12, and WSM) and ASM indicated that selection for faster growth could undesirably increase age at maturity. Since native chickens exhibit dual purpose potential (meat and egg production), the use of selection indices that simultaneously aim to enhance growth while reducing age at sexual maturity is crucial for improving their overall economic performance.

کلیدواژه‌ها English

Heritability estimation
Maternal genetic effects
Native chickens
Genetic correlations
Selection indices

  • تاریخ دریافت 08 آبان 1404
  • تاریخ بازنگری 10 آذر 1404
  • تاریخ پذیرش 10 آذر 1404